Rui Pereira assinou com os sub-23 do Trofense, deixando assim de fazer parte do plantel do Maximinense.
O jovem avançado, de apenas 19 anos, muda-se assim do campeonato da I Divisão da AF Braga para o campeonato de Esperanças da AF Porto.
Rui Pereira fez a formação no Fintas e SP Arcos, tendo jogado o último ano de júnior no Maximinense, clube onde se estreou como sénior.